El Rector es el Ing. José Antonio Chang Escobedo
Es el personero y representante legal de la Universidad; es elegido por la Asamblea Universitaria por un periodo de 5 años y puede ser reelegido. Tiene las atribuciones y funciones siguientes:
- Preside el Consejo Universitario y la Asamblea Universitaria y hace cumplir sus acuerdos.
- Dirige la actividad académica de la Universidad y su gestión administrativa, económica y financiera.
- Presenta al Consejo Directivo, en su calidad de Presidente, el proyecto del Plan Anual de Funcionamiento y Desarrollo de la Universidad; y a la Asamblea Universitaria, su memoria anual.
- Refrenda los diplomas de Grados Académicos y Títulos Profesionales, y de distinciones universitarias, conferidas por el Consejo Universitario.
- Propone ante el Consejo Universitario, el nombramiento del Secretario General de la Universidad y de los funcionarios que dependen directamente del Rectorado.